瀬田クリニックグループの各医療機関は、セコム損害保険株式会社の自由診療保険「メディコム」協定病院となっています。免疫細胞治療や重粒子線治療、国内未承認の医薬品の使用等、多くの先端医療は自由診療や先進医療として高額の患者さん負担のもと行われていますが、メディコムは、公的保険が適用される標準的な治療だけでなく、このような自由診療となっている先端医療（科学的に有効性が確認される医療に限る）や先進医療に係る費用まで補償するがん保険です。瀬田クリニックグループの各医療機関は、メディコム協定病院となっておりますので、瀬田クリニック東京、瀬田クリニック新横浜、瀬田クリニック大阪、瀬田クリニック福岡において受診された免疫細胞治療（活性化自己リンパ球療法及び樹状細胞ワクチン療法等）については、患者さんの病状、経過に応じて、最大3コース（18回）まで、その実際に支払った治療費が保険金として給付の対象となります。

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